Magnetoterapie je využívána ve veterinární praxi i v domácnostech, zejména pro zvířata, jako jsou psi a kočky. Rozšířená je také mezi chovateli koní. Stejně jako u lidí, lze i u zvířat použít pulzní magnetoterapii pro rehabilitaci, regeneraci a pomáhá u nejrůznějších zdravotních problémů.

Naši čtyřnozí domácí mazlíčci často trpí podobnými onemocněními, jako jejich dvounozí majitelé.

Zvířata jsou na magnetické pole velmi citlivá a není neobvyklé, že často instinktivně vyhledávají společnost svých majitelů a chodí se k nim mazlit, když zrovna používají svůj přístroj pro magnetoterapii. Její aplikace pak u nich vyvolává stejné regenerační, protibolestivé a protizánětlivé účinky jako u lidí. Schémata použití a frekvence bývají totožné, doba aplikace může být kratší. Nejjednodušší je položit vhodný aplikátor přímo do pelíšku, zakrýt ho tenkou dekou či podložkou a terapie může úspěšně probíhat. Pro použití magnetoterapie u zvířat platí stejné kontraindikace jako u lidí. Při nejasnostech konzultujte s veterinářem a odborníkem.